Identification des microorganismesIdentification des microorganismes par des techniques de spectrophotométrie de masse (MALDI-TOF)

Identification des microorganismes par des techniques de spectrophotométrie de masse (MALDI-TOF)

L’identification des microorganismes peut s’avérer indispensable dans différents cas :

• En cas d’altération présumée microbiologique d’un produit, afin d’étudier les causes de l’altération et d’appliquer les mesures correctives nécessaires au processus
• Pour analyser les microorganismes présents sur les surfaces et dans l’environnement lors des processus de fabrication d’un produit
• Pour caractériser un microorganisme d’intérêt dans notre processus, comme dans le cas des cultures de départ
• Établir la traçabilité et déterminer, par exemple, si un microorganisme présent dans un produit provient d’une matière première déterminée
• Vérifier si le microorganisme est pathogène
• Caractériser la composition des biofilms

Jusqu’à l’introduction de l’EM MALDI-TOF, l’identification bactérienne reposait sur les méthodes développées par la bactériologie classique. Ces méthodes présentaient une série d’inconvénients, notamment la nécessité, dans la plupart des cas, de périodes d’incubation d’au moins 16 à 18 heures, ainsi que d’autres inconvénients techniques.

Par rapport à ces méthodes classiques d’identification, l’EM MALDI-TOF présente des avantages évidents :

• Elle permet d’obtenir une identification fiable en un court laps de temps, économisant ainsi, au minimum, ces 16 à 18 heures de croissance nécessaires dans les systèmes biochimiques d’identification
• L’analyse du profil protéique du microorganisme dans le spectre des 2-20 kDa, où se trouvent la majorité des protéines ribosomiques, offre pour la grande majorité des espèces bactériennes un profil spécifique, permettant de les différencier des autres avec une fiabilité similaire à celle offerte par les techniques de séquençage les plus courantes (ARNr 16S)